普通的“阿仁”因为严重社恐转学来到了一所“没有人类的学校”。在这里，阿仁的同学都是五花八门的动物，老师也是扬子鳄、熊猫这样的珍稀品类。作为一个平平无奇的人类，阿仁在吐丝、筑巢、发光、蜕皮等课程上不知所措，又在体育课被各种动物轮番碾压，甚至连文化课都惨遭“滑铁卢”。 除此之外，想要顺利从这所院校毕业，阿仁还需要完成一个特殊任务——用动物交友APP和全部小动物扩列成为好友。伴随着这个不可能完成的任务，一个从惴惴不安到依依不舍的温情搞笑故事开始了……
故事叙述一只叫暮光闪闪(TwilightSparkle)的小马为了执行导师塞拉斯提娅公主（PrincessCelestia）给她的任务，与助手斯穗龙（Spike）一起来到小马镇学习有关友谊的魔法的知识，其中她认识了苹果杰克（Applejack）、瑞瑞（Rarity）、小蝶（Fluttershy）、云宝黛西（RainbowDash）与碧琪（PinkiePie）五位好朋友，每只小马都代表着友谊的每个元素，并在和谐水晶（E... 故事叙述一只叫暮光闪闪(TwilightSparkle)的小马为了执行导师塞拉斯提娅公主（PrincessCelestia）给她的任务，与助手斯穗龙（Spike）一起来到小马镇学习有关友谊的魔法的知识，其中她认识了苹果杰克（Applejack）、瑞瑞（Rarity）、小蝶（Fluttershy）、云宝黛西（RainbowDash）与碧琪（PinkiePie）五位好朋友，每只小马都代表着友谊的每个元素，并在和谐水晶（ElementsofHarmony）中，各扮演重要的关键元素。此后，暮光闪闪(TwilightSparkle)便与她认识的新朋友们开始了有趣的日常生活，在第四季时暮光闪闪（TwilightSparkle）和她的五个朋友在第四集以及之后开始写日记。
在小镇的阳光森林幼儿园里，小朋友们每当遇到困难，他们心中的大英雄——百变校巴，就会变身成为警车、消防车、救护车、救援艇、潜水艇和飞机立刻赶到，利用渊博的知识和各种有趣的道具化解危机，守护小朋友的安全，解答小朋友的疑问，并且他和蔼可亲，是小朋友们的良师益友，平常帮助小朋友了解自己的情绪，学会处理社交问题。全新的《百变校巴》第六季，校巴歌德将继续陪伴小朋友，与大家一起进行各种体育运动。让小朋友认识自己的情绪，学会与人沟通，同时深入探索团队精神。并且通过介绍不同的运动规则，让小朋友学习更多运动科学知识，帮助他们安全锻炼身体，提高身体素质，在运动中收获乐趣。
