モルモットが車になった「モルカー」たちが繰り広げる物語を描き、ブームを巻き起こしたストップモーションアニメ「PUI PUI モルカー」を、CGアニメーションで映画化。
野菜を食べずに24時間働けるAIモルカーが登場し、ドライバーたちは次々と最新鋭のAIモルカーに乗り換えていた。そ んなある日、モルカーのポテトたちは、AIモルカーのカノンと謎の集団のカーチェイスに巻き込まれたところを、凄腕ドライバーに助けられる。近ごろ世間では行方不明になるモルカーが増えており、そのドライバーもいなくなった相棒のモルカー・ドッジを捜しているという。そこでポテトたちはカノンのAI機能を使い、行方不明のモルカーを捜す旅に出る。
テレビシリーズに続いて、モルカーの声には本物のモルモットの鳴き声を採用。ドッジのドライバー役で大塚明夫、AIモルカーを開発したベンチャー企業のCEO役で相葉雅紀が声の出演。原案およびテレビシリーズ第1期の監督・見里朝希が総監修を手がけ、「映画 すみっコぐらし とびだす絵本とひみつのコ」のまんきゅうが監督、「はたらく細胞」シリーズの柿原優子が脚本、気鋭のCGアニメーションスタジオ・モンスターズエッグがアニメーション制作を担当。
