本剧讲述了清扫过去“污垢”的清扫公司“整理整顿”的社长木之本大助（贺来贤人 饰），大助的幼驯染兼员工，因为事故而坐着轮椅生活的今井裕树（柄本时生 饰），两人的学弟兼员工，和谁都能搞好关系的奥田一平（落合扶树 饰），与揭露过去的“错误”报道撰稿人坂田苍（冈田将生 饰），以东京·墨田区锦系町为背景，通过与各种各样的人的相遇，面对自己的过去…
晚清，中国内忧外患。在曾国藩等人的筹办下，江南机器制造总局应运而生。邝福海受捻军的派遣前来阻挠，与梦想自建坚船利炮的徐华容结成生死之交。徐华容传播西方科学，推行洋务运动，阻止李鸿章用造船经费购买外国军舰，呕心沥血赶造兵舰，但最终功亏一篑。“甲午战争”惨败后，洋务运动破产，江南制造局成众矢之的。徐华容奔走呼号，惨淡经营，迎来辛亥革命。邝继业从日本回国后，在中共党人李印夏帮助下，发动工人运动，抗拒军阀掠夺，结束摩根称霸江南的时代。日本发动侵华战争，江南造船厂被长崎造船所吞噬。第三代江南共产党人孙翔龙、杨胜国和工程师汪同宾与日寇斗智斗勇，为新四军偷运军需物资，输送军工人才。解放伊始，江南造船厂为装备新中国第一支海军部队，成功实施一江山岛登陆作战立下了赫赫战功。
经历了八年抗战和国共内战，古老的中华大地终于迎来了黎明的曙光，作为全国金融中心，1949年的上海为一片洋洋喜气所笼罩。然而欢庆的背后，不敢落败的国民党派出大批特务潜入上海，企图趁政权未稳之际实行破坏活动，其中以管理保密局特务组织光复社德中将社长陈恭鹏（钱雁秋 饰）最为殷勤，他指示特务、奸商和青帮大肆进行银元投机和伪钞印刷，对上海乃至全国的金融市场造成极大破坏。为此，上海军管会着手实行了整顿经济的铁流行动，中共特纵特务营营长燕双鹰（张子健 饰）便在此时临危受命。 燕伪装成贩卖毒品的青帮分子混入上海，他与老奸巨猾的陈恭鹏展开连番角力，在这一过程中，他的生命和信仰也经受着巨大的考验……
本剧根据都梁的小说《百年往事》改编而成。清咸丰年间，京城琉璃厂的百年南纸店松竹斋因质优货全而为文人墨客喜爱，名满京门。1860 年的第二次鸦片战争中，松竹斋掌柜以古墨为郑元培将军止血疗伤、救其性命。郑将军以怀素和尚的《西陵圣母帖》和宋徽宗赵佶的《柳鹆图》为谢。第二代掌柜张山林（马维福 饰）沉溺玩乐，连带侄儿张幼林（李滨 饰）也无心读书。郑家后人秋月（杨斯 饰）沦落风尘，得刑部杨宪基大人（刘伟明 饰）搭救来到京城，终与张家相认。张幼林因打人入狱，却因祸得福结识了西北刀客霍震西（王心海 饰）。期间经营不善的松竹斋濒临破产，幸亏新掌柜庄虎臣（刘佩琦 饰）大力革新，松竹斋改号松鹤斋，才得以起死回生。成年的张幼林（张嘉译 饰）尽管对秋月有情，却终依母命，娶米店千金何佳碧（姚晨 饰）为妻。时光荏苒，下一代掌柜王仁山（郑晓宁 饰）与张家继续苦心经营松鹤斋，百年老店见证了一段血泪斑斑的中国近代史。
小小高涯县内暗藏危机；过往杨家灭门惨案究竟是何人所为？真假县令？真假夫君？“是否会真的隐去，假的存了？”且看俊俏马匪刘贝贝如何智斗恶霸，化解危机，伸张正义；千金小姐又如何火眼金睛找出如意郎君？
